財政部臺北市國稅局表示，納稅義務人辦理結算申報列報自用住宅購屋借款利息，應注意是否符合所得稅法第17條第1項第2款第2目之5及同法施行細則第24條之3規定各項要件，以避免因不符規定，而遭稅捐稽徵機關剔除補稅。
該局說明，依所得稅法施行細則第24條之3規定，購屋借款利息之扣除，應符合下列各要件：一、以納稅義務人本人、配偶或受扶養親屬名義登記為其所有。二、納稅義務人本人、配偶或受扶養親屬於課稅年度在該地址辦竣戶籍登記，且無出租、供營業或執行業務使用者。三、取具向金融機構辦理房屋購置貸款所支付當年度利息單據。是以，納稅義務人欲列報購屋借款利息之扣除額，除該房屋必須係以其本人、配偶或同一申報戶內之受扶養親屬名義登記為所有之外，於申報課稅年度內尚須由其本人、配偶或同一申報戶內受扶養親屬於該地址辦竣戶籍登記，始得列報扣除。
該局舉例，納稅義務人甲君96年度綜合所得稅結算申報案，列報甲君所有房屋之購屋借款利息，經查該房屋96年度雖有甲君之祖父設立戶籍，惟查得甲君96年度並未列報其祖父為受扶養親屬，不符合前揭所得稅法規定，予以剔除補稅。甲君不服申請復查，主張其祖父在該地址辦竣戶籍登記，並經稅捐稽徵機關核准同意以自用住宅稅率繳納房屋稅，系爭購屋借款利息得予以扣除等情，經該局已不符前揭所得稅法規定復查予以駁回。
該局進一步說明，前揭案例系爭房屋是否得以適用住家用稅率課徵房屋稅，係依據房屋稅條例之規定，納稅義務人購買自用住宅之貸款利息，是否得以列報為綜合所得稅之列舉扣除額，須符合所得稅法有關購屋借款利息之相關規定，二者之法源依據、立法意旨、相關規定要件均有所不同，不得比附援引，並不因為系爭房屋適用住家用之房屋稅率，其房貸利息即得列報為綜合所得稅之購屋借款利息予以扣除。
該局呼籲，納稅義務人若有購買自用住宅，欲列報扣除購屋借款利息，應注意各該申報課稅年度是否符合所得稅法之相關規定，以維自身權益。
資料來源：http://www.mof.gov.tw/ct.asp?xItem=60811&ctNode=657&mp=1